La storia segreta di Stewie Griffin

Il film inizia con un notiziario che annuncia la prima del film stesso; dopo aver assistito all'entrata in sala dei protagonisti del film, si procede alla visione tramite Quagmire che ne sta registrando un bootleg. La storia comincia alla piscina comunale di Quahog dove Peter e Lois incoraggiano Stewie a imparare a nuotare. Nel suo corso di nuoto Stewie conosce Brad, un suo coetaneo che lo batte in una gara di nuoto. Stewie per vendicarsi cerca di ucciderlo posizionando della dinamite alla base della sedia del bagnino. Quando Stewie aziona l'esplosivo però il meccanismo non funziona costringendo Stewie ad avvicinarsi ed esplodendo solo in quel momento. Stewie si ritrova all'inferno e ne rimane terrorizzato, così, risvegliatosi poco dopo, giura a sé stesso che cambierà vita e si comporterà bene.

Nel frattempo a Peter viene assegnata una rubrica del telegiornale di Channel 5 di Quahog intitolata Quello che mi fa davvero girare gli ingranaggi, dove critica liberamente tutto ciò che gli dà fastidio acquisendo popolarità e attirandosi l'invidia di Tom Tucker (Teo Bellia) . Stewie non riuscendo a controllare la sua indole decide di placare il suo istinto a fare il male tramite l'alcol. Andando in un pub con Brian i due si ubriacano e tornando a casa Stewie si mette al volante facendo un incidente. A causa dell'incidente di Stewie, di cui Tom Tucker approfitta per screditarlo in pubblico, Peter perde il lavoro.

Guardando la televisione Stewie vede un uomo a lui incredibilmente somigliante e, credendo che sia il suo vero padre, decide di andare a San Francisco per trovarlo. Approfittando del Camper di Quagmire che parte per un viaggio, Stewie e Brian partono per raggiungere San Francisco. Giunti alla meta Stewie vede l'uomo che aveva visto in televisione ma scopre che non si tratta di suo padre ma dello Stewie trentenne del futuro venuto in "vacanza" nel 2005. Stewie riesce a farsi portare nel futuro, per la precisione nel 2040, con lui: in questo modo scopre che a 35 anni sarà ancora vergine, lavorerà in un grande magazzino e vivrà in un monolocale.

Scopre inoltre che Chris sta per sposarsi ed è diventato un poliziotto, Meg un transessuale di nome Ron, Lois e Peter sono ancora vivi e che Brian è defunto mangiando della cioccolata trovata nella spazzatura (si vede in paradiso mentre beve un Martini con Ernest Hemingway, Vincent van Gogh e Kurt Cobain, tutti e tre morti suicidi). Stewie, disgustato dalla sua vita futura, decide di insegnare a Stu (così è soprannominato il suo alter ego trentacinquenne) ad avere un appuntamento con una ragazza e a perdere la verginità. I suoi tentativi falliscono e Stu perde il lavoro e la sua casa prende fuoco. Stu spiega a Stewie che la causa del suo fallimento è stata la sua esperienza pre-morte alla piscina che lo ha sempre costretto a comportarsi in maniera corretta. Stewie si fa allora portare indietro nel tempo dove evita la sua esperienza pre-morte e previene così il suo deprimente futuro, per poi farsi uccidere dallo Stewie di quel giorno. La storia finisce con il preciso momento in cui Meg decide di diventare transessuale.