The Bourne Supremacy

Da circa due anni, Jason Bourne (Matt Damon) trascorre una vita tranquilla a Goa, in India, insieme a Marie, che lo aiuta a ricostruire il suo passato. Nei suoi continui incubi, infatti, Jason rivive il proprio passato di sicario per la CIA agli ordini di Conklin.

A Berlino, Pamela Landy (Joan Allen), vicedirettore della CIA, e la sua squadra stanno segretamente portando a termine l'acquisto dei "file Neski", contenenti informazioni vitali su un furto da 20 milioni di dollari ai danni dell'Agenzia nonché l'identità di una talpa all'interno della CIA. Tuttavia, Kirill (Karl Urban), un agente dei servizi segreti russi, fa saltare la corrente dell'albergo, uccide i due agenti, lascia sul posto le impronte di Bourne per incastrarlo, ruba i file Neski e porta via i 3 milioni di dollari dell'acquisto, che consegnerà al magnate Yuri Gretkov (Karel Roden) . Per completare il lavoro, Kirill raggiunge Bourne a Goa per eliminarlo: insospettitosi, Bourne scappa in auto insieme a Marie, che viene uccisa da un proiettile esploso da Kirill. L'auto fuori controllo precipita da un ponte finendo in un fiume e Kirill si convince di aver eliminato Bourne, il quale, convinto che dietro l'uccisione della fidanzata ci sia ancora il suo superiore Conklin, è deciso a vendicarsi.

A Berlino segue un'indagine condotta da Pamela Landy, in cerca del responsabile del fallimento dell'acquisto dei file Neski. Landy scopre le impronte di Jason Bourne su un detonatore inesploso e decide di investigare sulla sua identità, venendo così a sapere dell'Operazione Treadstone, nella quale Bourne era coinvolto.

Landy interroga Ward Abbott (Brian Cox), vicedirettore dell'Operazione Treadstone, e gli spiega che i file Neski contengono il nome dell'agente che ha rubato i 20 milioni di dollari. Sette anni prima, infatti, il politico russo Vladimir Neski aveva contattato l'Agenzia dicendo di essere a un passo dallo scoprire l'identità del ladro, ma era stato ucciso poco tempo dopo in un hotel di Berlino da sua moglie, suicidatasi dopo l'omicidio. Il caso era rimasto archiviato finché una nuova fonte di informazioni non aveva contattato l'Agenzia comunicando di essere in possesso dei documenti e di essere disposta a venderli. Dopo il ritrovamento delle impronte di Bourne nell'hotel di Berlino dove aveva avuto luogo l'operazione fallita, Landy si convince che il responsabile del fallimento dell'operazione sia proprio l'ex agente CIA e che quest'ultimo fosse in combutta con il suo supervisore Alexander Conklin. Abbott e Landy, perciò, partono per Berlino, decisi a catturare Bourne.

Bourne, nel frattempo, sbarca a Napoli e si lascia identificare dalle forze dell'ordine, che lo arrestano e lo portano da un funzionario dell'ambasciata statunitense per essere interrogato. Bourne tramortisce il funzionario, copia la sua SIM card e intercetta una telefonata di Pamela Landy, venendo a sapere di essere ricercato per l'omicidio di Berlino. Bourne si reca a Monaco, a casa di Jarda (Marton Csokas), ultimo agente Treadstone e assassino di Conklin per ordine di Abbott, e viene a sapere che l'Operazione è stata chiusa dopo la morte di Conklin. Jarda tenta di immobilizzare Bourne prima dell'arrivo di una squadra CIA, ma Bourne lo uccide, fa esplodere la sua casa e fugge verso Berlino sulle tracce di Landy e Abbott, che stanno interrogando l'ex agente di supporto Nicky Parsons.

A Berlino, intanto, Danny Zorn (Gabriel Mann) (assistente di Ward Abbott ed ex collaboratore di Conklin) esamina la scena del furto dei file Neski e si accorge che il detonatore su cui Bourne ha lasciato le sue impronte è posizionato su una parte di centralina che non era necessario distruggere per togliere corrente all'albergo. Gli agenti Treadstone sono addestrati per non commettere alcun tipo di errore, così Zorn si insospettisce e ne parla con Abbott, che lo uccide affinché non parli con altri.

Bourne chiama Landy e viene a sapere perché la CIA è sulle sue tracce. In seguito, Bourne rapisce Nicky, che gli dice che il vero capo di Treadstone era Abbott e non Conklin. In un flashback, Bourne si ricorda della sua prima missione da agente Treadstone e realizza di essere l'assassino di Neski: Bourne ricorda di averlo ucciso, uccidendo anche la moglie e di aver inscenato un omicidio-suicidio mettendo l'arma del delitto in mano alla moglie di Neski.

Intanto, Pamela Landy comincia a nutrire sospetti su Abbott, che evade le sue domande. Bourne si rivolge all'unica persona ancora in possesso di informazioni su Treadstone, cioè, come rivelatogli da Nicky, lo stesso Abbott. L'ex direttore confessa di essere la talpa nella CIA e rivela che Kirill è un agente dell'FSB, assunto da Abbott tramite Gretkov per eliminare Bourne e insabbiare il problema. Bourne registra la confessione e la fa avere a Landy. Abbot, con le spalle al muro, si suicida di fronte a Landy.

Bourne va a Mosca per rintracciare Irena Neski (Oksana Akinshina), figlia di Vladimir, per rivelarle la verità sulla morte dei suoi genitori, ma viene intercettato da Kirill. Ne risulta un inseguimento, che si conclude quando Bourne costringe l'auto di Kirill a schiantarsi su uno spartitraffico di cemento. Bourne torna sui suoi passi e visita Irena, rivelandole la verità.

Grazie alla registrazione ottenuta da Bourne, Landy arresta Gretkov. Tempo dopo, Landy è a New York nel suo ufficio e viene contattata da Bourne: Landy lo ringrazia per le sue informazioni e gli rivela il suo vero nome, David Webb, la sua data di nascita, il 15 aprile 1971, e la sua città natale, Nixa, nel Missouri. Bourne si congeda dicendole: "Si riposi, Pam, ha l'aria stanca.", rivelando quindi che riesce a vederla, poi riattacca e sparisce tra la gente per le strade di New York.